研究方向
我们团队深耕分子进化与系统发育学领域，着重探究生命系统在不同层级的演化进程。我们以分子层面的相似性为线索，研究范围涵盖物种起源、个体发育乃至癌症发生等关键生物学现象，矢志推动发育生物学的计量化与理论化发展。通过整合实验生物学与计算生物学的前沿方法，我们聚焦于以下三大核心问题：
1. 复杂性状的系统发育溯源： 追溯地球上所有物种的共同祖先，其演化历程宛如一棵宏伟的生命之树。性状的出现与演变深深根植于这棵物种树的框架之中。为此，我们将运用比较基因组学与系统发育学相结合的研究策略，在物种演化的宏观尺度上，解析复杂性状（例如睡眠、智力、神经性疾病等）的分子机制、细胞基础及其精细的空间分布模式。
2. 细胞谱系示踪技术解析细胞群体动态： 犹如物种起源于共同祖先，多细胞生物的亿万细胞亦源于一枚受精卵。受精卵如何历经分裂与分化，最终构建出精密的有机体，是生命科学的迷人谜题。此前，我们已在酵母、果蝇及斑马鱼模型中成功构建高分辨率的细胞谱系追踪系统（SMALT）。未来，我们将把这一先进系统应用于哺乳动物（如小鼠），绘制复杂多细胞生物的细胞谱系图谱，从而深入理解不同细胞类型、组织器官在胚胎发育、器官稳态维持、衰老以及癌症发生等生理及病理条件下的动态变化规律。
3. 发育生物学研究的计量化与理论化： 借鉴群体遗传学等成熟的研究手段，我们将系统发育学中用于物种树分析的计量化算法与经典理论迁移至细胞谱系研究，旨在建立一套基于细胞谱系的标准化细胞群体计量化研究范式。更进一步，我们将整合标准化的细胞谱系数据，构建“数字孪生胚胎”人工智能模型，以期推动发育生物学从经验驱动的归纳总结迈向智能化预测的新纪元。
教育经历
(1) 2012-09 至 2015-07, 中国农业大学, 生物科学, 学士
(2) 2015-09 至 2021-12, 色情小说网站
, 生物化学与分子生物学, 博士
工作经历
(1) 2022-01 至 2024-12, 博士后, 色情小说网站
(2) 2025-03 至今 色情小说网站
副教授
学术成就
邓善俊，男，1994年出生于广东佛山，现任色情小说网站
副教授，博士生导师。其研究领域聚焦于分子进化与系统发育学，并在多细胞生物细胞谱系研究方向取得了显著成就，不仅构建并完善了从技术开发到实际应用的细胞谱系示踪完整研究体系，更在该领域持续深耕。目前，主要研究兴趣涵盖复杂性状的系统发育起源解析、哺乳动物细胞谱系追踪前沿技术的开发，以及发育过程中细胞群体动态特征的计量化与理论体系构建。近年来，在Nature、Nature Methods、National Science Review等国际顶尖学术期刊以第一作者或通讯作者身份发表多篇具有高影响力的研究论文。
承担课题
1. 科技部国家重点研发计划（2024YFC3407100）， 在体智能进化技术及应用，2024-12 至 2027-12, 1400万元，在研，参与
2. 科技部国家重点研发计划（2021YFA1302500），小鼠细胞命运决定过程中基因表达网络的系统演化规律研究，2022-01 至 2026-12, 2600万元，在研，参与
3. 国自然青年科学基金项目（32200492），脊椎动物脏器形成过程中有效祖先细胞群体大小研究，2023-01 至 2025-12，30万元，在研，主持
4.中国博士后科学基金第17批特别资助（2024T171090），脊椎动物胚胎发育中各细胞类群的全局分化图谱研究，2024-07 至 2024-12，18万元，结题，主持
代表性论文专著
1. Zhaolian Lu#, Shanlan Mo#, Duo Xie#, Xiangwei Zhai#, Shanjun Deng#, Kantian Zhou, Kun Wang, Xueling Kang, Hao Zhang, Juanzhen Tong, Liangzhen Hou, Huijuan Hu, Xuefei Li, Da Zhou, Leo Tsz On Lee, Li Liu, Yaxi Zhu, Jing Yu, Ping Lan, Jiguang Wang , Zhen He*, Xionglei He*, Zheng Hu*. Polyclonal-to-monoclonal transition in colorectal precancerous evolution. Nature, 2024, 636(8041): 233-240. （2024年度“中国生物信息学十大进展”）
2. Shanjun Deng#; Han Gong#; Di Zhang; Mengdong Zhang; Xionglei He*. A statistical method for quantifying progenitor cells reveals incipient cell fate commitments. Nature Methods, 2024, 21(4): 597-608.
3. Di Zhang#; Ao Zhang#; Xionglei He*; Shanjun Deng*. Variation in cancer risk between organs can not be explained by the degree of somatic clonal expansion. Advanced Biotechnology, 2024, 2(2): 1-8. （封面文章）
4. Shanjun Deng#; Xionglei He*. Tree of life at two levels: from species to cell. Science Bulletin, 2023, 68(21): 2515-2518.
5. Shanjun Deng#; Ke Xing#; Xionglei He*. Mutation signatures inform the natural host of SARS-CoV-2. National Science Review, 2022, 9(2): nwab220.
6. Kehui Liu#; Shanjun Deng#; Chang Ye#; Zeqi Yao; Jianguo Wang; Han Gong; Li Liu; Xionglei He*. Mapping single-cell-resolution cell phylogeny reveals cell population dynamics during organ development. Nature Methods, 2021, 18(12): 1506-1514.
发明专利
1. 贺雄雷; 刘黎; 叶畅; 刘科辉; 邓善俊;基于激活诱导性胞苷脱氨酶的诱导突变蛋白的制备和用途, ZL202010285948.1, 色情小说网站 ，国家发明专利（已授权），专利转化1000万元。
